Eawag : La diversité des poissons menacée dans les ruisseaux est recensée
Grâce à la pêche systématique dans les cours d'eau suisses, les chercheurs de l'Eawag ont documenté plus de 40 espèces de poissons dans le cadre du "Progetto Fiumi". L'équipe de l'Eawag a en outre découvert une diversité au sein des espèces qui n'avait été que partiellement recensée auparavant. Le projet fournit ainsi des bases pour la protection de cette diversité génétique et écologique.
Les cours d'eau de Suisse abritent une biodiversité unique. Afin de la recenser pour la première fois de manière plus précise, des chercheurs de la division Ecologie et évolution des poissons ont procédé à des pêches systématiques dans des centaines de rivières et de ruisseaux en septembre et octobre entre 2013 et 2018 dans le cadre du projet "Progetto Fiumi". "Plus de la moitié des captures étaient des truites", explique Jakob Brodersen, qui coordonne le projet financé par l'OFEV. "Et nous en avons trouvé dans presque tous les habitats - des petits ruisseaux de montagne à plus de 2000 mètres d'altitude jusqu'en plaine". Au total, les chercheurs ont prélevé des poissons dans 308 sites répartis dans toute la Suisse et dans tous les types de rivières et de ruisseaux.
On savait depuis longtemps que toutes les truites n'étaient pas identiques. Ainsi, on distinguait jusqu'à présent cinq espèces qui se sont développées de manière totalement distincte dans les grands systèmes fluviaux. La truite de rivière (Salmo trutta) dans les affluents du Rhin, la truite du Doubs (Salmo rhodanensis), la truite marbrée et la truite italienne (Salmo marmoratus et Salmo cenerinus) dans les affluents de l'Adriatique et la truite de la mer Noire (Salmo labrax) dans l'Inn. De même, dès le début du 20e siècle, des biologistes suisses spécialisés dans les poissons ont signalé l'existence de différentes formes de truites autour des lacs de l'Engadine.
Nouvelles connaissances sur la diversité des truites
L'équipe de Brodersen a systématiquement documenté les multiples variations entre les espèces et au sein de celles-ci - et a ainsi découvert des formes qui se distinguent par leur apparence, leur comportement et, en partie, leur patrimoine génétique. Des études menées dans le bassin versant du lac des Quatre-Cantons ont par exemple montré que les truites vivant dans des ruisseaux au débit régulier se spécialisent davantage dans le choix de leurs proies que les truites vivant dans des ruisseaux sauvages au débit très fluctuant. Dans les Grisons, les chercheurs ont comparé les truites de rivière vivant à basse altitude dans des conditions environnementales plus favorables avec leurs cousines vivant dans le cours supérieur aride des torrents. Mais contrairement à ce que l'on attendait, les "truites de haute montagne" n'étaient pas plus petites lorsqu'elles ont frayé pour la première fois, mais bien au contraire significativement plus grandes que les truites de plaine - une information importante lorsqu'il s'agit de fixer des mesures de capture minimales. Et dans le canton de Vaud, les autorités et les gardes-pêche ont attiré l'attention de l'équipe sur un ruisseau dans lequel des truites avec des points côtoient d'autres sans points. Des analyses génétiques ont révélé que les animaux à points sont proches des autres truites de rivière des environs, mais pas de leurs voisins sans points, avec lesquels ils ne se reproduisent généralement pas non plus.
Base de données de la diversité des poissons
L'équipe de l'Eawag a également trouvé des adaptations écologiques et des formes locales différentes chez toutes les autres espèces de poissons - des chabots, très répandus, aux barbeaux, vairons et autres carpes, qui dominent dans les grands cours d'eau à courant lent. Les premières analyses génétiques n'ont pas confirmé certaines hypothèses émises jusqu'à présent et indiquent qu'il faut s'attendre à des surprises chez ces espèces également.
Une collection a été constituée pour poursuivre l'étude de la diversité intraspécifique, largement inconnue jusqu'à présent. Elle comprend aujourd'hui plus de 10'000 poissons, 20'000 échantillons de tissus ainsi que des échantillons environnementaux qui renseignent sur le réseau alimentaire des sites de prélèvement. "La collection de l'Eawag à Kastanienbaum est disponible comme base de données à grande échelle pour des études locales", explique Jakob Brodersen. "Inversement, elle est constamment élargie et affinée grâce aux informations fournies par la population et aux études locales".
Pour une protection efficace
La collection est d'ores et déjà utilisée pour différents projets de recherche appliquée. En effet, la diversité des poissons est menacée par les aménagements des ruisseaux, les obstacles à la migration, les problèmes d'éclusées en aval des centrales électriques et d'autres influences humaines. Avec la nouvelle loi sur la protection des eaux, la Suisse entend assainir les habitats fortement dégradés. Le Progetto Fiumi fournit entre autres des bases pour les programmes de monitoring et la recherche appliquée. Il aide ainsi à utiliser les investissements pour les mesures d'assainissement de manière à ce qu'elles soient vraiment utiles aux poissons et que la diversité génétique ne soit pas perdue avant même d'avoir été correctement recensée.
Inventaire aussi dans les lacs
De manière similaire au "Progetto fiumi", l'Eawag a étudié de 2010 à 2015 la diversité des poissons dans les lacs proches des Alpes dans le cadre du "Projet Lac". En collaboration avec les cantons, l'Office fédéral de l'environnement, l'Université de Berne et le Musée d'histoire naturelle de la Commune de Berne, ainsi que d'autres partenaires, plus de 70 espèces de poissons ont été identifiées. De nombreuses espèces issues de grandes profondeurs d'eau, notamment les corégones et les ombles, ne sont présentes que dans certains lacs, où elles sont apparues au cours de l'évolution - la plupart du temps seulement depuis la dernière période glaciaire - en s'adaptant aux habitats extrêmes. Cependant, de nombreuses espèces de poissons qui vivaient autrefois en eau profonde ont à nouveau disparu avec la surfertilisation des lacs. www.eawag.ch/projetlac
